Gefangenenakten.- Zugangsbücher.- Verstorbene Gefangene.- Analysen und Berichte der Leitung.- Protokolle.- Arbeitsplanung.- Politische Arbeit.- Kaderabteilung.- Finanzen.- Medizinische Dienste.- Besondere Vorkommnisse.- Zutrittsgenehmigungen für Betriebsfremde.- Gesundheitsunterlagen.- Personalakten.

1952 wurde der Strafvollzug der Deutschen Volkspolizei unterstellt. Für die Strafvollzugseinrichtung Waldheim geschah dies erst 1956. Mit der Unterstellung unter das Sächsische Ministerium für Justiz im Jahr 1990 erfolgte zugleich die Umbildung in eine Justizvollzugsanstalt.